Sebastian Bornauw débute le football au Maroc du côté du Wydad Casablanca avant de retourner en Belgique au HO Wolvertem puis au FCV Dender avant de rejoindre le centre de formation du Sporting d'Anderlecht. Bornauw effectue ses débuts professionnels lors de l'année 2018 avec les Mauves où il se fait très vite remarquer. Une saison plus tard, Bornauw quitte les Mauves et rejoint Cologne contre un chèque de 6 millions d'euros.
En Allemagne, Bornauw s'impose très vite et ses bonnes prestations lui permettent d'être sélectionné chez les Diables Rouges pour la première fois le 8 octobre 2020 lors du match amical contre le Côte d'Ivoire (match nul 1-1) où il monte au jeu. En 2021, Bornauw rejoint Wolfsburg contre un chèque de 13,5 millions d'euros. Passé par toutes les catégories d'âge chez les espoirs, Bornauw compte quatre capes en sélection nationale.